La nostra storia
fonte: archivio online SIUSA (Sistema Informativo Unificato per le Soprintendenze Archivistiche)
Non è stato possibile reperire la data certa di istituzione della Direzione didattica 1° circolo di Assisi; la documentazione presente in archivio ne attesta l'attività già nel corso del secondo quarto del secolo XX (inizio anni Trenta).Fino al 1963 era denominata Direzione didattica di Assisi, quindi, con la costituzione della Direzione didattica 2° circolo di Assisi ha, presumibilmente, assunto l'attuale denominazione.
Nell'anno scolastico 1961/62, grazie alla volontà di alcuni cittadini e genitori della frazione di Petrignano di Assisi, iniziarono a funzionare, presso la sede delle scuole elementari, due prime classi di scuola media, una maschile ed una femminile. Le classi, costituite rispettivamente da ventuno e undici allievi, dipendevano dalla Scuola secondaria statale di avviamento professionale a tipo industriale e commerciale maschile e femminile "Vittorio Emanuele Fiumi" di Assisi con sezione distaccata di Scuola media unificata, con la quale condividevano la presidenza.Per l'anno scolastico successivo si rese necessario reperire aule più attrezzate rispetto a quelle messe a disposizione dalla scuola elementare e le classi vennero trasferite nel locali al piano terra dell'abitazione privata dell'imprenditore Alfredo Drappo, adattati dal Comune di Assisi.
La Direzione didattica 2° circolo di Assisi, situata a Santa Maria degli Angeli, è stata istituita con il decreto n. 8720 del 24 aprile 1963 del provveditorato agli studi di Perugia, ereditando alcune scuole già amministrate dalla Direzione didattica 1° circolo di Assisi. Ha operato fino al 31 agosto 2003.Al momento della chiusura facevano parte della Direzione i seguenti plessi: quattro scuole dell'infanzia, Santa Maria degli Angeli, Tordandrea, Petrignano, Torchiagina; cinque scuole primarie, Giovanni XXIII, Patrono d'Italia, Tordandrea, Petrignano, Palazzo.I plessi di Petrignano, Torchiagina e Palazzo sono confluiti, sempre nel 2003, nel nuovo Istituto comprensivo Assisi 3 di Assisi.
Gli spazi rimanevano comunque angusti e l'assessore alla Pubblica istruzione di Assisi, Enzo Boccacci, sollecitò Alfredo Drappo ad adoperarsi per costruire un edificio attiguo alla sua abitazione da destinare alla scuola. La nuova sede, data in concessione al Comune, previo pagamento di un canone di affitto, venne inaugurata con l'anno scolastico 1964/65. La Scuola proseguì la sua attività come sezione staccata della Scuola media statale "Vittorio Emanuele Fiumi" di Assisi.
La Scuola proseguì la sua attività come sezione staccata della Scuola media statale "Vittorio Emanuele Fiumi" di Assisi per poi divenire autonoma il 17 novembre 1972, con nota n. 8474 del Ministero. Gli alunni provenivano da Petrignano e da Torchiagina.
Nel 1985 la scuola si trasferì nella sede definitiva di via Croce, realizzata dal Comune.
Nel 2000, insieme alla Scuola media statale Galeazzo Alessi di Santa Maria degli Angeli di Assisi e alla Scuola media statale Frate Francesco di Assisi ha dato vita alla Scuola media statale di Assisi, poi Istituto di istruzione secondaria di primo grado di Assisi, costituitasi come unica segreteria e presidenza.
L'Istituto Comprensivo Assisi 3 è nato nel 2003 dall'accorpamento tra la sede di Petrignano di Assisi dell'Istituto di istruzione secondaria di primo grado di Assisi e i quattro plessi di scuola dell'infanzia e scuola primaria di Petrignano di Assisi, Torchiagina e Palazzo di Assisi, fino ad allora amministrati dalla Direzione didattica 2° circolo di Assisi.